酶標儀實際上就是一臺變相的光電比色計或分光光度計，其基本工作原理與主要結構和光電比色計基本相同. 圖示是一種單通道自動進樣的酶標儀工作原理圖.光源燈發出的光波經過濾光片或單色器變成一束單色光，進入塑料微孔極中的待測標本.該單色光一部分被標本吸收，另一部分則透過標本照射到光電檢測器上，ELISA試劑盒光電檢測器將這一待測標本不同而強弱不同的光信號轉換成相應的電信號.電信號經前置放大，對數放大，模數轉換等信號處理后送入微處理器進行數據處理和計算，zui后由顯示器和打印機顯示結果. 微處理機還通過控制電路控制機械驅動機構X方向和Y方向的運動來移動微孔板，從而實現自動進樣檢測過程.而另一些酶標儀則是采用手工移動微孔板進行檢測，因此省去了X,Y方向的機械驅動機構和控制電路，從而使儀器更小巧，結構也更簡單.
微孔板是一種經事先包理于放置待測樣本的透明塑料板，板上有多排大小均勻一致的小孔，孔內都包埋著相應的抗原或抗體，微孔板上每個小孔可盛放零點幾毫升的溶液.
光是電磁波，波長100nm～400nm稱為紫外光，400nm～780nm之間的光可被人眼觀察到，大于780nm稱為紅外光。ELISA試劑盒人們只所以能夠看到色彩，是因為光照射到物體上被物體反射回來。綠色植物之所以是綠色，是因為植物吸收的大部分為紅橙光和藍紫光，但對綠色不吸收，反射出來，所以植物呈現為綠色。酶標儀測定的原理是在特定波長下，檢測被測物的吸光值。酶標儀檢測單位
光通過被檢測物，前后的能量差異即是被檢測物吸收掉的能量，特定波長下，同一種被檢測物的濃度與被吸收的能量成定量關系。
但是每一種物質對光能量還存在一定的非特異性吸收，為了消除這種非特異性吸收，我們再選取一個參照波長，以消除這個不準確性。在參照波長下，檢測物光的吸收zui小。檢測波長和參照波長的吸光值之差可以消除非特異性吸收。檢測值計算
標儀進行檢測時，儀器其實要進行35個點的測量，選取zui中間的5個點的均值為本孔的OD值。
參照通道是用來校準由于電壓不穩或燈泡磨損帶來的影響。用途和其它提示
用于ELISA試劑的測定，廣泛用于各種實驗室，包括臨床實驗室。質量控制
質量控制是試劑檢測的重要因素。請按照試劑說明書的要求進行質量控制。空白校正
有一些試劑盒的說陰書將空白孔設置為空氣，其它大多數空白孔的設置是用試劑來設置的，請按照試劑盒的說明書要求進行。檢測結果的解釋
由于有相當多的因素會影響檢測的結果，如不同的酶標板，檢測試劑的體積，都會造成OD值的不同，因此，只有使用同一酶標板反應的試劑檢測結果才能比較和分析。對結果的臨床解釋請依照試劑盒的ELISA試劑盒說明書進行
酶標儀所用的單色光既可通過相干濾光片來獲得，也可用分光光度計相同的單色器來得到.在使用濾光片作濾波裝置時與普通比色計一樣，濾光片即可放在微孔板的前面，也可放在微孔板的后面，聚光鏡，光欄后到達反射鏡，經反射鏡作90°反射后垂直通過比色溶液,然后再經濾光片送到光電管.
從酶標儀工作框圖和光路圖上可看出，它和普通的光電比色計有以下幾點差異：
在單通道酶標儀的基礎上又發展了多通道酶標儀，此類酶標儀一般都是自動化型的.它沒有多個光束和多個光電檢測器，如 12個通道的儀器設有 12條光束或 12個光源，12個檢測器和12個放大器，在X方向的機械驅動裝置的作用下，樣品12個為一排被檢測.多通道酶標儀的檢測速度快，但其結構較復雜價